Подлодка U 504 отчаливает 27 июля 1943 г. в Жиронде (долина р.Луиры) ни пути к Бордо в последний боевой поход. Уже три дня спустя они была потоплена ни выходе из Бискайского залива. Полностью снаряжения подлодка глубоко сидит в воде. Слабое зенитное вооружение (только одна установка спаренных пулемётов) этой лодки сыграло катастрофическую роль при атаке союзных самолетов – охотников за субмаринами. К 13 июля 1943 г. первые 40 лафетов для спаренных 2-см пушек поступили па базы в Западной Франции. Они сразу же были установлены на рубки II типа подлодок, выходящих в море. Некоторые из подлодок серии IXС сохранили 3,7-см зенитные полуавтоматы до конца лета 1943 г., хотя их демонтаж начался ещё 13 марта 1943 г.

Всего с 1939 по 1943 гг. было заказано 214 подлодок серии IXС и серии IXС/40, из них было построено и сдано флоту всего 54 подлодки серии IXС и 88 подлодок серии IXС/40. Таким образом, по числу построенных серийных подлодок этот тип занимает второе место после подлодки серии VII.

Подлодки IX серии в противоположность средним подлодкам VII серии предназначались в первую очередь для операций на дальних океанских просторах. Однако с началом 2-й мировой войны в наличии имелось только 5 подлодок этого типа в боевой готовности. К тому же оказалось, что они малопригодны для таких операций. Три из пяти были потеряны уже в первые 6 недель морской войны. К осени 1940 г. оставшиеся в наличии-две подлодки серий IX А и IX В чаще всего использовались порознь, главным образом в Бискайском заливе, а также западнее Пиренейского полуострова для расширения прохода в Гибралтарском заливе. Позже они привлекались для участия в операции по захвату Норвегии.

После оккупации Франции немцы получили в свое распоряжение Бискайскую военно-морскую базу и возможность судам снабжения проникать в центральную Атлантику. К концу 1940 г. область операций подводных лодок была расширена на центральные и южные районы Атлантики у африканского побережья. 11 декабря 1940 г. U 65 серии IX В стала первой немецкой подлодкой, которая во время войны впервые пересекла экватор, держа курс на юг. Однако медленно растущий выпуск подлодок вынудил немецкое командование использовать подлодки IX серии в групповых соединениях (в так называемых волчьих стаях) против вражеских конвоев в Северном канале и в восточной Атлантике. После вступления в войну Италии в июне 1940 г., а позже после оккупации Греции, захваченные военно-морские базы сделали возможным боевое применение подлодок VII серии в Средиземном море и позволили убрать из этого района боевых действий подлодки IX серии. Хотя они создавались именно для этого района боевых действий. К тому же средние подлодки VII серии лучше соответствовали условиям этого сравнительно ограниченного района боевых действий.

U 172 с модернизированной рубкой II-го типа в центральной Атлантике во время заправки топливом из подлодки U 847, едва заметной сзади, 24 августа 1943 г. Спустя 3 дня U 847 была потоплена. Из-за большой угрозы воздушных атак было усилено наблюдение. Лодка помимо двух 2-см зенитных автоматов была вооружена двумя дополнительными зенитными спаренными пулемётами MG 81Z. Шахта штыревой антенны перестроена в верхней части для установки выдвижной вращающей антенны локатора FuMO 30.

В каждом случае указана первая подлодка верфи с новым вооружением.

С началом операций в районе североамериканского восточного побережья в январе 1942 г. и последовавшего расширения районов боевых действий на Карибское море и северо-восточное побережье Южной Америки была рассмотрена возможность использовать подлодки IX серии в качестве подводных танкеров. Эти «дойные коровы» создавались для дозаправки субмарин в открытом море. После выхода в море в боевой поход первой подлодки U 66 серии IXС 13 мая 1941 г., лодки типа С отныне стали основной продукцией IX серии .

Возобновление регулярных конвойных операций в Северной Атлантике в июле 1942 г. привело к широкому боевому использованию соединений новых подлодок типа С в этом районе. С октября 1942 г. подлодки серии IXС появились в районе Капстадта (ныне Кейптаун – ЮАР, район мыса Доброй Надежды), где ещё из- за слабого противодействия можно было получить хорошие боевые результаты. С января 1943 г. немецкое командование увеличило также присутствие подлодок серии IXС в центральной Атлантике против конвоев идущих на восток из США с важными военными грузами для североафриканского ТВД. Активизация борьбы против конвоев следующих в Англию заставила вновь отправить на их поиски подлодки IX серии из французских гаваней в Северную Атлантику. Однако уже к середине мая 1943 г. оказалось, что наибольшие потери в процентном соотношении несут подлодки серии VIIС, возникла реальная опасность потерять и другие подлодки. Па основании этого командование тотчас же вывело из района Северной Атлантики все подлодки IX серии, как более важные для океанских операций. Основной причиной возросших потерь стали неповоротливость и недостаточная устойчивость подлодок IX серии во время атак глубинными бомбами. Другой причиной этих неудач оказалось слишком большое время погружения после

получения сигнала тревоги, что делало лодку уязвимой во время воздушных атак. Гак же оказалось, что в Северной Атлантике чаще всего пустые хранилища запасных торпед, устроенные под верхней палубой, из-за недостаточной прочности при срочном погружении или при близком разрыве глубинных бомб частично разрушались вовнутрь. При этом резкое увеличение веса носовой части вследствие прибывающей забортной воды вызывало внезапное погружение, что часто заканчивалось гибелью лодки.

После катастрофических неудач в мае 1943 г. на коммуникациях в Северной Атлантике немецкое командование направило в конце июня того же года подлодки IX серии в Индийский океан. Ставка делалась на то, что в этом в районе со слабой противолодочной обороной подлодки кригемарине будут действовать в большей безопасности. Хотя попасть в этот район боевых действий было нелегко, требовалась по меньшей мере одна дозаправка.