Самолеты других типов, состоящие на вооружении некоторых приведенных выше эскадрилий, не указаны.
Самолеты «Супер Хорнет» также имеются на вооружении экспериментально-исследовательской эскадрильи 1/Х-23 (авиабаза Патаксент-Ривер, шт. Мэриленд) и эскадрильи боевого применения VX-30 (авиабаза Чайна-Лэйк, шт. Калифорния).
В июле 2002 г. эскадрилья VFA-115 на борту авианосца «Авраам Линкольн» была направлена в Персидский залив — предстоял рутинный шестимесячный поход, однако плавание продолжалось десять месяцев, за время которых эскадрилья дважды принимала участие в боевых действиях против Ирака.
Первые боевые вылеты летчики этой эскадрильи выполнили на «Супер Хорнетах» еще над Афганистаном, но оружие тогда полетах не применялось. Лейтенант Стивен Уэллборн из 115-й эскадрильи так охарактеризовал эти полеты: «Полеты планировались так, чтобы на практике проверить способность самолета выполнять посадки с максимально допустимой массой, при этом применение вооружения изначально не предполагалось. Боевой вылет продолжался от пяти до шести часов с дозаправкой в воздухе. В большей степени это была демонстрация флага».
Реальные боевые вылеты с применением вооружения самолеты F/A-18E 115-й эскадрильи выполнили в конце 2002 г. в период проведения операции «Southern Watch». Истребители-бомбардировщики патрулировали запретную для полетов иракских самолетов зону и несли по две 907-кг бомбы в сочетании с подвесными топливными баками и УР «воздух-воздух». Данный вариант вооружения был выбран в расчете на посадку на авианосец с полной боевой нагрузкой, чтобы не выходить за ограничения по максимальной посадочной массе. В первых пяти вылетах оружие не применялось. В шестом вылете командир пары лейтенант-коммендер Джон Тёрнер получил приказ нанести удар по позициям иракских ЗПК, обстрелявших самолет коалиционных сил. На цели с двух F/A- 18Е было сброшены четыре 907-кг бомбы BLU-109, поражение целей летчики наблюдали с помощью аппаратуры контейнеров ATFLIR. На отходе от цели самолеты попали под огонь зенитной артиллерии, но попаданий отмечено не было.
В ходе операции «Southern Watch» самолеты «Супер Хорнет» выполнили 214 боевых вылетов и сбросили по 14 целям 22 КАБ JDAM.
В январе 2003 г. авианосец «Авраам Линкольн», за три недели до планового окончания похода, получил приказ задержаться в Персидском заливе, а в марте началась операция «Iraqi Freedom» — вторжение международных сил в Ирак. В операции вновь приняли истребители-бомбардировщики эскадрильи VFA-115.
Обычно боевые вылеты выполнялись с боевой нагрузкой из четырех 907-кг бомб с лазерным или спутниковым наведением. Объектами ударов, в основном, являлись стратегические объекты нефтепререрабатывающей промышленности Ирака, расположенные в глубине страны. Впервые выполнялась дозаправка в воздухе над территорией противника, что стало возможным только с появлением «Супер Хорнет» — первого в авиации ВМС США заправщика, «способного постоять за себя». «Супер Хорнеты» не только наносили удары по наземным целям и использовались в качестве самолетов-заправщиков, но также выполняли тактическую разведку, а двухместные F/A-18F применялись как самолеты передового авианаведения.
При выполнении разведывательных заданий самолеты несли разведывательные контейнеры AST-228 ATFLIR (Advanced Tactical Forward- Looking Infrared) и ASD-12V. В эскадрилье VFA-115 имелось четыре разведывательных контейнера ATFLIR, испытания которых еще не были завершены. Из-за низкой надежности систем ATFLIR, летчики предпочитали использовать в боевых вылетах более старые контейнеры AAS-38B Nite Hawk: «Качеству изображения мы предпочли надежность работы».
Полеты на дозаправку в воздухе в качестве танкеров выполнялись с четырьмя подвесными 1800-литровыми баками под крылом, полностью заправленными топливом и заправочным агрегатом A/A42R-1 на центральном подфюзеляжном пилоне (эта конфигурация известна как «5 wet configuration») и УР «воздух — воздух» в «типовом» варианте вооружения для ведения воздушного боя. Лейтенант Уэллборн отметил, что «за исключением дозаправки в сложных метеоусловиях, «Супер Хорнет» выполнял данные задачи хорошо. Большим преимуществом «Супер Хорнета» перед S-3B является бортовая РЛС, позволяющая достоверно оценивать тактическую обстановку и управлять заправляемыми самолетами».
С полной заправкой внутренних баков и пятью подвесными баками «Супер Хорнет» несет топлива почти в два раза больше, чем S-3B; суммарная масса топлива во всех баках «Супер Хорнет» составляет 13154 кг. Согласно лейтенанту Уэллборну, обычное задание на дозаправку состояло из полета в одном боевом порядке с ударными самолетами до точки дозаправки над Ираком (до 300 км в глубь территории Ирака), возвращением на авианосец, прием топлива, взлет и дозаправка самолетов ударной группы на пути от цели. Дозаправка осуществлялась на высоте 9100 м при скорости полета 510–518 км/ч (заправщики S-3B выполняли дозаправку на эшелонах 4900 или 550 м при скорости 460 км/ч).
F/A-18E из состава VFA-113 готовится к боевому вылету против Ирака. 25 марта 2003 г.
С палубы авианосца "Авраам Линкольн" стартует F/A-18E. Под крылом подвешены лазерная бомба GBU-16 (под левой консолью) и три 454-кг бомбы (под правой), на законоцовках крыла — ракеты "Сайдуиндер", под фюзеляжем — топливный бак
В ходе операции «Iraqi Freedom» экипажи эскадрильи VFA-115 налетали 5400 часов и выполнили 24463 посадки на авианосец, было сброшено 172 368 кг боевой нагрузки.
Помимо «Супер Хорнетов» из VFA-1 15 в операции «Iraqi Freedom» приняли участие четыре самолета данного типа из авиакрыла авианосца «Нимиц» (два из эскадрильи VFA-14 и два из VFA-41), переброшенных на авианосец «Авраам Линкольн». «Супер Хорнеты» взлетели 30 марта с авианосца «Нимиц», находившегося у берегов США, и выполнили посадку на атолле Диего-Гарсия в Индийском океане, преодолев за 5 часов 2250 км над водной поверхностью. На первом этапе маршрута (650 км) четыре «Супер Хорнета» сопровождали три заправщика S-3B. Пилотировавший F/A-18Е лейтенант-коммендер Джэйсон Норрис позже признался: «Я нервничал, не в отношении полетов в Ираке, а перед длительным перелетом над океаном». На следующий день четыре F/A-18E/F преодолели с двумя дозаправками от танкеров КС-135 маршрут в 3700 км от Диего-Гарсия до авианосца «Авраам Линкольн», находившегося в Персидском заливе, время перелета составило почти 7 ч.
Через 12 ч после посадки на «Ликольне» экипажи «Супер Хорнетов» авиакрыла авианосца «Нимиц» уже присутствовали на предполетной подготовке. Первый полет считался ознакомительным, однако уже в этом полете экипаж F/A-18F эскадрильи VFA-41 поразил КАБ с лазерным наведением две БМП в районе международного аэропорта Багдад. F/A-18F выполняли боевые вылеты с контейнерами ATFLIR в боевых порядках пар, причем несколько раз ведомыми были F/A-18E из эскадрильи VFA-115 или F-14D из эскадрильи VF-31. Боевая работа выполнялась из положения дежурства в воздухе. В одном вылете выполнялась четыре дозаправки: попутная (от F/A-18E) на маршруте к району патрулирования, непосредственно перед патрулированием (от заправщика ВВС США), через час патрулирования (от заправщика ВВС США) и встречная (от F/ А-18Е) при возвращении на авианосец. Общее время патрулирования составляло два часа, причем патрулирование выполнялась в двух районах — смена района производилась после дозаправки в воздухе. Координаты цели выдавались с земли, но поиск самих целей экипажи выполняли с помощью аппаратуры ATFLIR.
2 апреля экипаж F/A-18F в составе летчика лейтенант-коммендера Марка Вейсгербера и оператора вооружения лейтенант-коммендера Брайна Гэррисона выполнил ночной боевой вылет в район Карбалы. В этом полете «Супер Хорнет» с «Нимица» впервые попал под огонь малокалиберной зенитной артиллерии, который, впрочем, ущерба не причинил, так полет выполнялся на высоте 3000 м. По команде с земли экипаж вышел в заданный район, самостоятельно обнаружил цель и поразил ее КАБ с лазерным наведением. Затем экипаж (точнее — пару, ведомым являлся F-14D) направили ближе к Багдаду. В окрестностях Багдада был отмечен сильный огонь зениток, трассы которых существенно снизили эффективность очков ночного видения. Первым удар по скоплению бронетехники нанес «Томкэт» (двумя КАБ), затем — «Супер Хорнет», уничтоживший одной КАБ танк. Повторную атаку выполнили британские СВВП «Харриер» GR.Mk 7. «Супер Хорнет» и «Томкэт» ушли на авианосец; в этом полете дозаправка в воздухе выполнялась трижды.
