Прототипами Do 335B-2 стали машины Do 335M13 (W.Nr. 230013, RP+UP), а также Do 335M14 (W.Nr. 230014, RP+UQ). Силу огня увеличили, разместив в крыльях две 30-мм пушки МК 103 с боекомплектом 70 выстрелов на ствол. Считая еще одну пушку, установленную в развале блока цилиндров, самолет нес три 30-мм пушки. Кроме того, было решено установить 20-мм пушку MG 151/20. Предусматривалась возможность замены пушки на два 15-мм пулемета MG 151. Для этого арсенала требовался боекомплект. Чтобы его разместить, пришлось уменьшить объем крыльевых топливных баков с 300 до 220 литров. Двигатели оставили прежними.

Do 335M13 облетали 31 октября 1944 года. На самолете стояли двигатели DB 603E-1 (передний) и DB 603QE-1 (задний). Do 335M14 закончили в декабре 1944 года, после чего аэродром Менген был занят французами.

Программа Do 335B-2 сильно задержалась. Серийный выпуск этих самолетов первоначально планировалось начать на фирме Heinkel в Ораниенбурге в июне 1944 года, но в итоге дату перенесли на февраль 1945 года. Неизвестно, был ли вообще построен хоть один Do 335B-2, или хотя бы велись какие-то приготовления в этом направлении.

На прототипе Do 335M13 испытали новые оконцовки крыльев, увеличивающие размах до 13,84 м. На правом крыле самолета установили кинокамеру в аэродинамическом обтекателе.

Развитием Do 335B-2 должен был стать Do 335B-3. На этот самолет планировалось установить двигатели DB 603LA с двухступенчатым наддувом. Двигатель DB 603LA представлял собой двигатель DB 603L, дополнительно оборудованный устройством MW-50. Двигатель оптимизировали для большой высоты. Стартовая мощность DB 603L составляла 1820 л.с./1339 кВт, а боевая 1675 л.с./1232 кВт. Модификация LA развивала стартовую мощность 2000 Л.С./1472 кВт и боевую 1510 л.с./1111 кВт. Как видно, двигатель был значительно мощнее, чем применявшиеся прежде моторы серий А и Е. Однако форсированные моторы еще не производились серийно, а работы по их доводке задерживались. В мае 1944 года Дорнье начал требовать от Daimler-Benz хотя бы два таких мотора, которые можно было бы поставить на прототип Do 335B-3. Срок поставки моторов определили на июнь 1944 года, но даже осенью ни одного мотора получить не удалось.

В качестве прототипов Do 335B-3 использовались машины Do 335M18 (W.Nr. 240314), М19 (W.Nr. 240315) и М20 (240316). Все три перечисленных самолета находились в Оберпфаффенхофене на разных стадиях сборки. В таком виде они и попали в руки американцев.

Истребительные части, занимавшиеся перехватом союзнических бомбардировщиков, очень надеялись на новые истребители. При своих габаритах и массе они представляли собой идеальную платформу для тяжелого вооружения. Однако даже три 30-мм и две 20-мм пушки не представляли для самолета предела. Самолет мог нести еще более тяжелое вооружение. Вместо пушки МК 103, расположенной в развале блока цилиндров, предполагалось поставить 55-мм пушку МК 112, имевшую массу 272 кг и скорострельность 300 выстрелов в секунду. До конца войны успели собрать только десять прототипов 55-мм пушки, и ни один из них не был установлен на «Стреле». Можно только представлять каков был бы эффект от попадания хотя бы одного снаряда в бомбардировщик противника.

Do 335B-4 должен был быть разведчиком без вооружения и оборудованный фотокамерами в бомбоотсеке. Его конструкция базировалась на проекте Р.237.3. Принципиально, это было повторение Do 335A-4 с теми особенностями, что были характерны для Do 335В. Основное отличие самолета заключалось в крыльях размахом 18,4 м с площадью 43 м2, разработанных для Do 335V4. На самолет планировалось ставить двигатели DB 603LA, что позволило бы достичь неплохих летных качеств.

Такие же крылья и двигатели должны были стоять и на Do 335B-5, представлявшим собой аналог Do 335А-12. Ночной двухместный истребитель Do 335В-6 имел стандартные крылья. Пятьдесят таких машин заказали Хейнкелю со сроком поставки апрель 1945 года. На самолет предполагали поставить радар FuG 220, а затем перейти на FuG 218. Прототипом серии стал Do 335М17 (W.Nr. 240313), который не успели закончить до конца войны. О судьбе прототипа расскажем ниже. Другим прототипом В-6 должен был стать Do 335M21 (W.Nr. 240317).

Технически продвинутым проектом был ночной истребитель Do 335В-7 с крыльями размахом 15,4 м, площадью 41 м2 и ламинарным профилем. Прототип проекта Do 335M22 (W.Nr. 240319) остался неоконченным. На самолет планировалось поставить моторы DB 603LA. В сентябре 1945 года в серию должен был пойти высотный истребитель с крыльями размахом 18,4 м и площадью 43 м2 — Do 335B-8. На самолет планировали поставить 2 20-мм пушки и одну 30-мм пушку, стрелявшую через вал винта. В качестве прототипа выбрали Do 335M23 (W.Nr. 230320), но и его не достроили.

Начиная войну, Германия не имела адекватной защиты от стратегических бомбардировщиков противника. Никому и в голову не могло прийти, что налеты предпримут такой размах. Первоначально, для отражения налетов хватало зенитной артиллерии и некоторого числа истребителей, однако чем дальше, тем ситуация обострялась.

Летом 1942 года к налетам подключились американцы. Тогда союзники разделили обязанности. Американцы совершали дневные налеты, а англичане бомбили ночью. Англичане бомбили по площадям, не жалея бомб. Показательным был налет на Кельн, совершенный 30 мая 1942 года. В течение 150 минут на город сбросили бомбы 1046 самолетов! В ходе предыдущих налетов бомбардировщики шли небольшими группами друг за другом, что растягивало операцию на семь часов. Это давало возможность немцам перехватывать самолеты противника. В упомянутом налете на Кельн англичане применили новую тактику, отправив бомбардировщики на цель одной большой группой. Люфтваффе не имела ресурсов перехватить такую армаду, поскольку в распоряжении немцев было сравнительно немного ночных истребителей.

Первоначально в качестве ночных истребителей использовали переделанные дневные истребители. В самом начале единственным ночным оборудованием было… развитое ночное зрение пилота. Позднее появились первые примитивные радары. Постепенно радары совершенствовались, также как и самолеты, на которых их ставили. Летом 1942 года несколько фирм получили заказ на создание специализированных ночных истребителей. До этого времени эффективнее всего ночью действовали истребители Bf HOG, а также Ju 88C и Ju 88G. Новыми специализированными ночными истребителями стали Focke-Wulf Та 154 и Heinkel He 219 «Uhu». He 219, наверное, был лучшим ночным истребителем люфтваффе во 2-й Мировой войне. Однако их было слишком мало, чтобы переломить ситуацию. Свою роль сыграли и интриги «на высшем уровне». Эрнст Хейнкель не пользовался влиянием у высших руководителей Рейха, в том числе и Мильха. Поэтому лучший немецкий ночной истребитель не имел никаких шансов на быстрое введение в строй. Травля Хейнкеля усиливалась по мере ухудшения обстановки на фронте. В результате, в роли ночного истребителя приходилось использовать любые истребители, хоть сколько-нибудь годящиеся на эту роль. Так появился истребитель Me 262B-1/U1. Ночные истребители создавались на базе Аг 234 и даже Не 111. Очевидно, что такая же судьба ждала и Do 335.

В 1944 году теоретически удалось показать, что на базе Do 335 можно создать идеальный ночной истребитель. Хорошие летные характеристики сочетались с большим внутренним объемом, что позволяло установить на самолете мощное вооружение и радар. Быстро подготовили проект Do 335А-6 на базе А-1. Экипаж увеличили до двух человек. За кабиной пилота оборудовали место оператора радара, также оснащенное катапультой. Для этого пришлось изменить топливную систему. Бак в фюзеляже уменьшили до 600 л, а, чтобы сохранить дальность полета, под крыльями подвесили два 300-литровых бака. В крыльях разместили небольшие баки с воднометанольной смесью для устройства MW-50. Благодаря этому устройству можно было кратковременно форсировать двигатели DB 603E до 2000 л.с. На выхлопные патрубки установили коллекторы.