Полетная палуба предназначалась только для старта самолетов, посадка колесных самолетов планировалась на береговые аэродромы или на авианосцы. Оборудовали ангар длиной 60 м (по другим данным, 40 м). Для подъема самолетов на верхнюю палубу имелись лифты.

По первоначальному проекту авиагруппа должна была состоять из 22 пикирующих бомбардировщиков "D4Y4" "Суисей" (американское кодовое название "Джуди"). Но к моменту возвращения в состав флота переоборудованных "Исе" и "Хьюги" их в наличии не было. Пришлось укомплектовать авиагруппу гидросамолетами "Е16А1" (американское кодовое название "Поль"). 24 августа 1943 года во время ходовых испытаний на борту "Исе" находились пикировщики "Айчи D3A1" (кодовое обозначение "Вэл").

Следует отметить, что большую часть службы линкоры-гибриды вообще не несли самолетов.

Линейный корабль "Исе". 1930 г. (Наружный вид)

Одновременно усилили зенитную артиллерию. Так, по завершении работ на кораблях находилось 16 127-мм орудий (8 спаренных установок). Все спаренные 25-мм автоматы были демонтированы, их место заняли трехствольные автоматы. На момент завершения работ на борту кораблей их было 57. Обновили радиоэлектронное вооружение. Стандартное водоизмещение линкоров-авианосцев стало достигать 35350 т, полное 38676 тонн, длина 219,6 м. На испытаниях линкоры достигли скорости хода 25,3 узла.

В июне 1944 года вновь усилили зенитное вооружение кораблей — число 25-мм зенитных автоматов довели до 108 (31 трехствольный и 15 одноствольных). Тогда же на "Исе" и "Хьюге" появились новые радиолокационные станции. В конце 1944 года стало ясно, что новых самолетов для них нет и не будет, на полетной палубе установили 25-мм зенитные автоматы. Для увеличения углов обстрела средней группы башен главного калибра убрали катапульту.

Заложен 10 мая 1915 года на военно-морской верфи "Кавасаки" в Кобе, спущен на воду 12 (по другим данным, 2) ноября 1916 года, вошел в состав флота 15 декабря 1917 года. После прохождения испытаний и курса боевой подготовки стал флагманом 2-й дивизии линейных кораблей первого флота. Участия в боевых действиях не принимал. Первая модернизация состоялась в 1921 году — на линкоре установили 4 80-мм орудия.

В апреле 1922 года в японские воды пришел совершавший кругосветное путешествие линейный крейсер "Ринаун", на его борту находились наследник британского престола принц Эдуард и его родственник лорд Маунбаттен. "Исе" был кораблем-хозяином приема и удостоен высочайшего посещения. Затем для линкора началась рутинная служба: учения, маневры, стрельбы, редкие визиты в заграничные порты — в основном в китайские.

В 1929-1930 гг. на военно-морской верфи в Кобе была проведена первая модернизация. Объем работ был весьма небольшим, была изменена конфигурация носовой надстройки.

В июне 1934 года "Исе" стал флагманом международной эскадры, отдававшей последние почести победителю при Цусиме адмиралу X. Того. С 1 августа 1934 года по 23 марта 1937 года корабль проходит большую модернизацию на военно-морской верфи в Кобе. По завершении работ линкор поддерживал японские войска, воюющие в Китае. В октябре 1940 года "Исе" принимал участие в большом параде кораблей японского флота, которые прошли на рейде Иокогамы, в присутствии императора Хирохито.

1941 год прошел под знаком подготовки к войне.

7 декабря 1941 года "Исе" встретил в составе 2-й дивизии линейных кораблей Первого флота. Он вместе с остальными кораблями своего соединения находился на рейде Хасирадзимы. Но после получения информации об успехе нападения на Перл Харбор выходит в море, чтобы прикрыть возвращение авианосного соединения адмирала Нагумо. 13 декабря происходит торжественное возвращение соединения на базу.

В начале 1942 г. "Исе" стоит на рейде в полной боевой готовности, изредка выходя в море на учения и стрельбы. 5 марта 1942 года американские авианосцы адмирала Хэлси атаковали объекты на атолле Маркус. Из лагуны Трука на перехват вышли японские авианосцы, которые должны были перехватить их, если они продолжат движение к японскому побережью. 11 марта на поиск вражеских кораблей выходят "Исе" и "Хьюга", на следующий день они встречаются с крейсерами "Тама", "Кисо" и эсминцами охранения. Поиск оказался безрезультатным. 16 марта японские корабли прибыли в бухту Исе. 20-24 марта состоялся переход Исе-Хасирадзима.

18 апреля стартовавшие с авианосца "Хорнет" (CV 8) армейские бомбардировщики сбросили бомбы на Токио и еще несколько японских городов. С рейда Хасирадзимы в море вышли все линкоры 2-й дивизии, сопровождаемые 10 эсминцами. Поиск оказался безрезультатным, вражеские корабли не были обнаружены. Единственной их добычей стало советское торговое судно "Ангарстрой".

24 апреля "Исе" прибыл в Хасирадзиму.

5 мая 1942 года линкоры 2-й дивизии, а также "Нагато" и "Мутсу" вышли в море, на очередные стрельбы. Они были завершены раньше запланированного времени, после затяжного выстрела в башне линкора "Хьюга". Он, сопровождаемый линкором "Фусо", пошел в Куре на ремонт, остальные корабли вернулись на базу. 11 мая на "Исе" обнаружилась неисправность клапанов турбин во 2-м машинном отделении, и линкор пошел в Куре на ремонт. Во время ремонтных работ на корабле установили радиолокационную станцию "Тип 21" обнаружения морских и воздушных целей. 25 мая работы были завершены, в этот же день провели ходовые испытания и пробу нового оборудования.

К сожалению, единственный корабль императорского флота, имевший радиолокатор, был включен в группировку, действовавшую на второстепенном направлении, но не был зачислен в состав авианосного соединения. Вероятно, наличие "Исе" позволило бы обнаружить вражеские пикировщики гораздо раньше, что могло значительно изменить ход сражения при атолле Мидуэй. Но линкор в составе своей 2-й дивизии был отправлен прикрывать высадку на Алеутских островах.

Операция по вторжению на Мидуэй и Алеуты получила кодовое обозначение "MI" и была проведена с 29 мая по 5 июня и закончилась после полного разгрома авианосного соединения адмирала Нагумо. "Исе" контактов с врагом не имел. В начале июня линкор вернулся на базу. 17 июня была проведена серия испытаний радиолокационной станции, результаты которой оказались удовлетворительными. 22-24 июня состоялся межбазовый переход Куре-Хасирадзима. По прибытии на рейд линкор был оставлен в состоянии готовности к немедленному выходу в море.

Тем временем в Токио, в стенах морского министерства, а точнее, отдела Морской авиации, решалась его судьба. Из этого отдела "наверх" ушло предложение перестроить "Исе" в авианосец, могущий принять на борт 54 самолета. Это позволило бы хоть как-то восполнить потери, понесенные в сражении у Мидуэя. Но это предложение не прошло, было принято компромиссное решение переоборудовать их в гибрид линкора с авианосцем.

14 июля линкоры типа "Исе" были переподчинены непосредственно командующему Объединенным флотом. До конца года "Исе" занимался боевой подготовкой в водах Метрополии, пройдя докование в Куре с 21 по 29 ноября 1942 года.

Первые два месяца нового 1943 года прошли спокойно. 23 февраля корабль был выведен в резерв 4 категории (самой низкой). Этот день считается началом переоборудования корабля в линкор-авианосец.

Работы шли достаточно быстро. 7 августа экипаж корабля и рабочие завода были свидетелями завершения немецкой операции "Марко Поло" — в Куре прибыла немецкая подводная лодка "U-511". Позднее она будет подарена А. Гитлером императору Хирохито и зачислена в состав японского флота как "RO 500".