В 1914 г. началась Первая мировая война. В августе 1915 г. Николай II принял на себя обязанности Верховного главнокомандующего и переехал из Царского Села в Ставку — город Могилёв. Через некоторое время в Ставку к отцу переехал и цесаревич Алексей. Учителя и воспитатели отправились вслед за ним. Алексею тогда исполнилось 12 лет, и его учебную программу адаптировали к 4–5 классу классической гимназии. Занятия продолжались шесть дней в неделю, по 4 урока в день. Особый упор делался на изучении языков. Государь-отец считал, что пребывание в Ставке Верховного главнокомандующего давало больше жизненного опыта наследнику Российского Престола, чем все вместе взятые кабинетные уроки. Ефрейтор Алексей Романов с гордостью носил обычную солдатскую форму, высокие русские сапоги. Его любимой пищей стали «щи и каша и чёрный хлеб, которые едят все мои солдаты», как он всегда говорил. Ему каждый день приносили пробу щей и каши из солдатской кухни Сводного полка. По воспоминаниям окружающих, цесаревич съедал всё и ещё облизывал ложку, сияя от удовольствия и говоря: «Вот это вкусно — не то, что наш обед».

Цесаревич Алексей с отцом на фронте.

Почти весь 1916 г. цесаревич Алексей провёл вместе с отцом, сопровождал его во всех поездках в действующую армию, награждал отличившихся в боях бойцов. П. Жильяр вспоминает: «После смотра Государь подошёл к солдатам и вступил в простой разговор с некоторыми из них, расспрашивая их о жестоких боях, в которых они участвовали. Алексей Николаевич шаг за шагом следовал за отцом, слушая со страстным интересом рассказы этих людей, которые столько раз видели близость смерти. Его обычно выразительное и подвижное лицо было полно напряжения от усилия, которое он делал, чтобы не пропустить ни одного слова из того, что они рассказывали». Во время войны Цесаревич Алексей был награждён серебряной Георгиевской медалью 4-й степени. По мнению А. А. Мордвинова, флигель-адъютанта Николая II, наследник «обещал быть не только хорошим, но и выдающимся монархом».

В начале марта 1917 года Император Николай II вынужден был отречься от престола не только за себя, но и за сына: «не желая расставаться съ любимым сыном Нашимъ…» П. Жильяр описал, как он сообщил эту новость Царевичу Алексею: «Я объяснил ему тогда, что Государь отрёкся от престола в пользу Великого Князя Михаила Александровича, который, в свою очередь, уклонился.

— Но тогда кто же будет Императором?

— Я не знаю, пока никто!..

Ни слова о себе, ни намёка на свои права наследника. Он сильно покраснел и был взволнован. После нескольких минут молчания он сказал:

— Если нет больше Царя, кто же будет править Россией?

Я объяснил ему, что образовалось Временное правительство, которое будет заниматься Государственными делами до созыва Учредительного собрания, и что тогда, быть может, его дядя Михаил взойдёт на престол. Я ещё раз был поражён скромностью этого ребёнка».

Сразу же с момента отречения Царская Семья была заключена под стражу в Царском Селе, а в августе была отправлена в ссылку в Тобольск. Там Алексей упал с лестницы и получил травмы, после которых долго не мог ходить. После переезда в Екатеринбург весной 1918 года болезнь его обострилась. Жизнь Царской Семьи в Екатеринбурге в доме инженера Ипатьева была подчинена строгому тюремному режиму: изоляция от внешнего мира, скудный продовольственный паёк, часовая прогулка, обыски, унижения, враждебность стражи. Но, несмотря на это, до последнего дня своей жизни Алексей продолжал учиться. Обучением сына занимались сам Государь, мать Александра Фёдоровна и лейб-медик Евгений Сергеевич Боткин. По многим свидетельствам, Царская Семья не тяготилась вынужденной замкнутостью жизни. Они так любили друг друга, им так было хорошо и интересно друг с другом, что огорчало их только переживание за Россию и проявление человеческой грубости и жестокости. В трагическое время семью объединяла общая молитва, вера, надежда и терпение. Находясь в окружении недругов, узники обращались к духовной литературе, укрепляли себя примерами Спасителя и святых мучеников. Алексей всегда присутствовал на богослужении, сидя в кресле. У изголовья его кровати висело множество иконок на золотой цепочке.

Цесаревич Алексей не дожил до своего четырнадцатилетия нескольких недель. В ночь на 17 июля 1918 г. он был расстрелян вместе с родителями и сёстрами в подвале Ипатьевского дома.

В ночь с 16 на 17 июля 1918 года семья Романовых и их слуги были расстреляны в подвале Ипатьевского дома по постановлению Уральского Совета рабочих, крестьянских и солдатских депутатов.

В списке жертв семеро членов семьи:

— Николай Александрович, 50 лет.

— Александра Фёдоровна, 46 лет.

— Ольга, 22 года.

— Татьяна, 21 год.

— Мария, 19 лет.

— Анастасия, 17 лет.

— Алексей, 13 лет.

А также — лейб-медик Евгений Сергеевич Боткин, повар Иван Михайлович Харитонов, камердинер Алексей Егорович Трупп, горничная Анна Степановна Демидова.

До сих пор в народе существует мнение, сформированное нашим социалистическим прошлым, что царская семья была справедливо наказана за преступления против народа, а также считается, что ответственность за убийство царской семьи лежит непосредственно на палачах, а государство никакой ответственности за это преступление не несёт.

В ссылке в Тобольске. 1916 г.

В последние два десятилетия членами семьи Романовых и их сторонниками был поднят вопрос о реабилитации царской семьи и проживавших с ними лиц. Главная вина расстрелянных, по мнению современного Дома Романовых, состояла в том, что с точки зрения Советской власти «Государь, Государыня и их дети оставались символами исторической России».

Юристами Дома Романовых была обобщена информация из исторических источников, которая неопровержимо свидетельствовала о том, что «Царская Семья подверглась политическим репрессиям со стороны советского государства по классовым, социальным и религиозным признакам. Лишение царской семьи свободы и других прав, ужесточение арестантского режима происходило по прямым указаниям главы советского государства — председателя Всероссийского центрального исполнительного комитета Я. Свердлова. Постановление о смертной казни вынес орган государственной власти Уралсовет. После приведения приговора в исполнение он был «признан правильным» Всероссийским центральным исполнительным комитетом. <…> Не подлежит никакому сомнению, что Царская Семья была репрессирована в виде заключения под стражу, ограничения прав и свобод, а потом и лишения жизни по решениям государственных органов, которые хоть и отдавали преступные и аморальные распоряжения, но всё-таки не являлись бандами уголовников»[10]. Таким образом, согласно Закону Российской Федерации «О реабилитации жертв политических репрессий», все члены царской семьи подлежали реабилитации и восстановлению их в гражданских правах.

Реабилитация царской семьи была нужна современному Российскому государству для того, чтобы оно навсегда закрыло в своей истории страницу произвола, беззакония и террора. Иначе получалось, что государство продолжало вслед за ВЦИКом «признавать правильной» казнь в подвале Ипатьевского дома. Наше современное государство, считающее себя преемником всех периодов Российской истории, должно было засвидетельствовать перед всем миром эту преемственность в юридическом акте реабилитации Императора Николая II и его семьи.

1 октября 2008 года Президиум Верховного Суда РФ признал Николая II и его семью жертвами политических репрессий и реабилитировал их. При этом было официально признано, что расстрел был осуществлён от имени государства.