В интерьере это был зальный храм с открытым алтарем, обрамленным шестью каменными колоннами, окружавшими алтарь, и с деревянным резным иконостасом. Периметр внутренних стен обрамляли каменные приставные колонны с треугольными завершениями пролетов. Все-таки католическая готика, видимо, оказалась непонятой русскими мастерами, и при ремонтах храма многое было изменено, так как при игумении Сергии Урусовой (1871–1884) интерьер храма был переделан с заменой деревянного иконостаса на мраморный; каменные колонны, окружавшие иконостас, были убраны, а иконы работы художника Тончи заменены иконами кисти художника Лебедева. Штукатурная лепнина, люстры и лампады были возобновлены в готическом стиле. Хоры и придельный храм на них были разобраны, а Казанский и Предтеченский приделы перенесены вниз и устроены в западной части храма. Главным входом в храм оставался западный, над которым для клиросного пения были устроены хоры на колоннах, обнесенные бронзовой решеткой от южной до северной стороны. Для монахинь монастыря был устроен в северной стене особый вход.

В строительстве церкви в 1812 г. принимал участие архитектор П. И. Керцели (25, с. 132).

Архитектор И. Т. Таманский в 1813–1817 гг. участвовал в восстановительных работах в Кремле, в частности в составлении проекта внутреннего убранства с иконостасом церкви Екатерины в девичьем монастыре (25, с. 236, рис. 491).

В конце XIX – начале XX в. территория монастыря ограничивалась с юга храмами св. Михаила Малеина и св. Екатерины. Далее на запад располагались Святые ворота, примыкавшие к Малому Николаевскому дворцу. Западной границей монастыря являлся трехэтажный игуменский корпус, в котором на первом этаже размещалась просфорня с кельями работающих в ней монахинь, на втором – покои игумении и казначеи, а на третьем – монастырский приют для девочек и две кельи для монашествующих. К игуменскому корпусу примыкал, продолжая западную границу обители против зданий Чудова монастыря, двухэтажный больничный корпус постройки 1877 г., разделенный в центре каменной лестницей на четыре части. В одном из отделений находилась монастырская больница с аптекой и кельями служащих при них сестер, в трех остальных жили монахини. Еще далее к северу по западной границе монастыря стояли каменные одноэтажные сараи.

Северной границей монастыря служил трехэтажный сестринский корпус с четырьмя входными коридорами-подъездами с лестницами, выходивший на сенатский двор. Третий этаж в нем был надстроен в 1863 г., а при игумении Рафаиле в западной части его была устроена общая прачечная палата.

Наконец, восточную границу монастырского двора замыкал двухэтажный сестринский корпус, по-видимому самый древний из жилых зданий обители. Он был разделен шестью поперечными сквозными коридорами с деревянными лестницами, ведущими на второй этаж. В южной части к этому корпусу было пристроено небольшое трехэтажное здание, соединявшее его с храмом св. Михаила Малеина с проездом на задний двор и с деревянной галереей на втором и третьем этажах заднего фасада. Вход на второй и третий этажи этого здания был общим с трапезой и с церковью св. Михаила Малеина. За этим корпусом к востоку располагался узкий проход между зданиями монастыря и кремлевской стеной. Этот проход соединял еще в древности Спасскую и Чудовскую улицы, но позднее был застроен частными и монастырскими сооружениями. В Вознесенском монастыре этот проход превратился в узкую внутримонастырскую сквозную улочку заднего двора, проходившую с юга под аркой церкви св. Михаила Малеина вдоль кремлевской стены и выходившую к сенатскому двору. Непосредственно к кремлевской стене в пределах Вознесенского монастыря примыкали сараи, помещения для монастырского скота и сеновал.

Известно, что в перестройке келейных корпусов монастыря принимал участие архитектор А. П. Попов (25, с. 201).

Как и другие монастыри России, Вознесенский монастырь до секуляризации церковных земель в 1764 г. был крупным феодальным собственником и имел более 16 тыс. крепостных крестьян. Его имения, подаренные разными благотворителями или завещанные по наследству, располагались во многих губерниях и уездах России: в Московской, Калужской, Самарской, Нижегородской губерниях; Московском, Рузском, Волоколамском, Городецком, Мещовском, Боровском, Симбирском, Новоторжском, Кашинском и других уездах – и включали десятки деревень, слобод и сел, рыбных ловель, мельниц, отдельных пастбищ и покосов. После Петровских и, особенно, Екатерининских земельных реформ все эти угодья отошли в казну, и у монастыря к началу XX в. остались лишь небольшие участки земли в Москве и ближнем Подмосковье, необходимые для хозяйственных нужд: в Зарядье, на Варварке, в приходе церкви вмч. Георгия небольшой участок с домами духовенства монастыря; в Басманной части, на Покровке, в приходе церкви вмч. Никиты около 7 десятин под строениями разных арендаторов; в Хамовнической части около 7 десятин луговой земли; мельница на Ходынском поле, переоборудованная арендатором в картонную фабрику; рыбные ловли в Бронницком уезде на реке Пехорке и на озерах Косном и Городном; в Рузском уезде дровяного леса 145 десятин; в Московском уезде, в селе Бибиреве, древнем владении монастыря, около 36 десятин луговой, пахотной и усадебной земли под монастырские огороды. Каменный храм с главным престолом во имя преп. Сергия Радонежского в Бибиреве, недавно восстановленный и действующий, построен в 1894 г. при активном участии сестер монастыря рядом с древней деревянной церковью в честь Благовещения Пресвятой Девы Марии. Всего в начале XX в. монастырю принадлежало 195 десятин земли. В нем находились игумения, 62 монахини и 45 послушниц.

Монастырь имел подворья в Москве. В 1752 г. ему принадлежали дворы в Китай-городе и Белом городе, а «для приезда властелинского» было еще одно подворье около Новодевичьего монастыря (72, с. 61).

В 1917 г. монастырь пострадал при обстреле Кремля, а вскоре был закрыт. Сначала предполагалось светское использование монастырских зданий, например церковь св. Екатерины собирались превратить в спортивный зал, но в 1928 г. было принято решение снести все здания Чудова и Вознесенского монастырей и Малый Николаевский дворец. На их месте по проекту архитектора И. И. Рерберга в 1928–1932 гг. было построено здание в классицистическом стиле для Военной школы ВЦИК, в котором позднее размещался Кремлевский театр, а затем Президиум Верховного Совета СССР.

При разборке Вознесенского собора останки погребенных княгинь и цариц – Евдокии (Евфросинии), Софьи Витовтовны, Софьи Палеолог, Натальи Кирилловны Нарышкиной и некоторые другие – были перенесены в подземную палату, пристроенную в 1801 г. к Архангельскому собору.

Четыре иконы из Вознесенского монастыря сохранились в Третьяковской галерее: «Богоматерь Одигитрия» 1482 г. работы Дионисия, «Богоматерь со свечой» и «Никита Новгородский» московской школы первой половины XVII в. и «Феодосия преподобная» 1690 г. мастера Кирилла Уланова (44, т. 1, с. 125).

Игумении

Венедикта (упом. в 1554–1571 гг.).

Леонида (упом. в 1594 г.).

Старицы княжна Ирина Мстиславская, княжна Александра Голицына и княгиня Софья Голицына были начальствующими лицами в монастыре в 1613 г.

Маремиана Воронова († 1617).

Евфимия Полтева (1622–1629).

Марфа Колычева (1629–1636).

Анастасия Сабурова (1637–1645).

Варсонофия Тиринова (1646–1648).

Александра Ромодановская (1648–1651).

Александра Кикина (1652–1654).

Мариамна Толстых (1655).

Евфимия Овцына (1657–1659).

Мариамна Пальчикова (1660–1666).

Иринарха Тимирязева (1656–1673).

Феофания Пашкова (1673–1686).

Варсонофия Бутурлина (1685–1709).

Евдокия Челищева (1710–1718).

Венедикта Даниловна Пушкина (1718–1730).