«Начи» атакован 5 ноября 1944 года около острова Коррехидор.

На следующий день после завершения работ на борту «Миоко» и «Хагуро», крейсера направились в Хсирадзиму, где приняли пехотный десант и грузы. 1 июля в последний раз корабли подняли якоря у родных берегов, которые им так больше не суждено было увидеть. Запасы топлива в Японии подходили к концу, поэтому корабли переводили на другие базы. Через три дня крейсера прибыли в Манилу, высадили здесь часть пассажиров и выгрузили часть груза, а затем через Замбоангу (8 июля) прибыли 12 июля в Сингапур. Здесь 19–28 июля «Хагуро» встал в док, а 31 июля оба крейсера перебазировались в Лингга-Роудс. В сентябре во время учений, отрабатывающих маневр в строю «Миоко» получил радар «22 го кай 4S». приспособленный для управления огнем артиллерии.

Для японских стратегов после завершения кампании на Марианских островах стало очевидно, что следующей целью американцев станут Филиппины. До 26 июля 1944 года был разработан план «Сё-Го», имевший целью провести очередное решающее морское сражение. В рамках плана крейсера 4-го дивизиона («Такао», «Атаго», «Майя» и «Чокай»), а также 5-го дивизиона вошли в состав «первого ударного отряда» (№ 1 бугай).

Утром 17 октября американские десантные корабли подошли к берегам острова Лейте (Филиппины). На следующий день в 11:10 из Лингаа-Роудс в море вышла оперативная группа, начавшая операцию «Сё 1» («Победа 1»), Командующий «Первого ударного отряда» вице-адмирал Курита вел в бой суперлинкоры «Ямато» и «Мусаси», линкоры «Нагато», «Фусо» и «Ямасиро», линейные крейсера «Конго» и «Харуна», тяжелые крейсера «Такао», «Атаго» (флагман), «Майя». «Чокай», «Хагуро». «Миоко», «Кумано», «Судзуя», «Тоне» и «Чикума», крейсер-авианосец «Могами», легкие крейсера «Носиро» и «Яхаги» в сопровождении 19 эсминцев. Через два дня весь отряд прибыл к Бруней. 22 октября ранним утром в порт вошел отряд вице-адмирала Куриты, а в 15:00 отряд вице-адмирала Нисимуры в составе линкоров «Фусо» и «Ямасиро». крейсера-авианосца «Могами» и четырех эсминцев направился в пролив Суригао. Адмирал Курита пошел в направлении пролива Сан-Бернардино.

Тем временем 21-й дивизион («Начи» и «Асигара») вместе с легким крейсером и семью эсминцами получили приказ выйти из Амами-О-Симы и присоединиться ко «Второму ударному отряду» в Маниле. 18 октября в 10:30 подводная лодка “Sterlet” (SS-392) на дистанции 15 миль обнаружила отряд крейсеров и доложила об этом. Получив это известие, на перехват вышли еще четыре подлодки, но только две из них — “Tigger" (SS-237) и “Tang” (SS-306) — смогли найти цель. Первая из них атаковала с дистанции 5 миль, но ее обнаружил и контратаковал самолет, заставивший лодку уйти под воду и прервать атаку. Вторая лодка никак не могла занять подходящую позицию, поскольку корабли шли со скоростью 19 узлов. 20–21 октября отряд провел на Формозе, пополняя запасы топлива. Выйдя из порта, крейсера снова наткнулись на подводные лодки противника: “Shark” (SS-314), “Seadragon” (SS-194) и "Blackfish” (SS-221). Первая из них пошла в атаку на крейсер и «авианосец», выпустив четыре электрические торпеды, которые ушли в никуда. Другие лодки сумели обнаружить цель, но не смогли занять позиции для атаки. Утром 22 октября в 8:00 капитан лодки “Icefish” (SS-367, капитан I — го ранга Петерсен) снова перехватил японские корабли, но опять не смог занять позиции для атаки. После двухчасового преследования, он поднялся на поверхность, чтобы передать донесение. Но бурное море и кружащие в небе японские самолеты заставили его снова уйти под воду, поэтому выйти на связь удалось только вечером. Несмотря на кишащие подводные лодки, эскадра вице- адмирала Симы 23 октября в 8:00 благополучно вошла в залив Колон.

Еще до входа в пролив Палаван отряд вице-адмирала Куриты построился в две колонны. В левой колонне первым шел крейсер «Атаго» (флагман), за ним следовали «Такао», «Чокай», «Нагато», «Кумано», Судзуя» и «Харуна». В правой колонне двигались «Миоко», «Хагуро», «Майя», «Ямато», «Мусаси», «Тоне», «Чикума» и «Конго». С флангов обе колонны прикрывали два легких крейсера и 15 эсминцев. Интервал между колоннами составлял 4000 м, скорость движения 16 узлов. Среди экипажей росла нервозность, наблюдатели то и дело докладывали о появлении американских подводных лодок. Тем временем, на пути у японского флота действительно стояли две подводные лодки: “Darter” (SS-227, капитан 3- го ранга Д.Х. Макклинток) и “Dace” (SS- 247, капитан 3-го ранга Б.Д. Клаггетт). В 01:16 24 октября 1944 года на радаре “Darter” появились импульсы, означавшие наводную цель. Перепроверив результаты визуально, командир передал сообщение во Фремантл, а оттуда его передали в штаб адмирала Холси.

В 6:32 командир “Darter” вышел на огневую позицию и с дистанции 900 м выпустил шесть торпед Мк 14 (300-кг БЧ) в направлении тяжелого крейсера «Агаго». Затем американец нырнул, развернулся под водой и выпустил с дистанции 1400 м четыре торпеды из кормовых аппаратов по шедшему следом тяжелому крейсеру «Такао». Из первых шести торпед в цель попали четыре. Это решило судьбу корабля. Когда крен достиг 54 гр, было решено снять с корабля экипаж. Эсминцы «Кисинами» и «Асасимо» приняли на борт около 700 человек, вместе с вице-адмиралом Куритой и частью его штаба. В 6:53 крейсер перевернулся и затонул носом вниз. Вместе с кораблем на дно ушло 360 членов экипажа, в том числе капитан корабля капитан 1-го ранга Цуто Араки.

Из четырех торпед, пущенных в «Такао», в цель попали только две. Первая из них угодила в район шпангоута № 180, что привело к затоплению котельных отделений №№ 4, 6 и 8. Вторая попала в район шпангоута № 335, повредив руль и оба винта правого борта. Крейсер остановился с креном 10 гр, но благодаря решительным действиям аварийных команд, и проведенному вовремя затоплению дифференциальных цистерн на противоположном борту, корабль удержался на плаву. Пожар, вызванный разлившемся из баков топливом, удалось потушить. Корабль в сопровождении эсминцев «Наганами и Акисимо» ночью ушел в Бруней. Двигаясь неполным ходом, крейсер прибыл туда 25 октября, прошел первоочередной ремонт, и 8 ноября направился в Сингапур для полного ремонта. На базу Селетар он прибыл через четыре дня.

В 5:54 атаковала лодка “Dace”. Четыре из шести пущенных торпед попали в левый борт тяжелого крейсера «Майя». Корабль резко накренился на 30? на левый борт, а пожар на баке вскоре вызвал детонацию артиллерийских погребов. После внутреннего взрыва «Майя» затонул, унося с собой 336 матросов и офицеров, в том числе капитана корабля Рандзи Оэ. Несмотря на внутренний взрыв и быстрое затопление, 769 членов экипажа сумели покинуть корабль. Их подобрал эсминец «Акисимо», передав на борт линкора «Мусаси». Когда на следующий день «Мусаси» тоже пошел ко дну, из этого числа снова было спасено 653 человека.

Вице-адмирал Курита посетил эсминец «Кисинами», а затем перенес свой флаг на борт «Ямато». В течение дня флот менял свой строй. Организационно подчиненный 4-му дивизиону крейсер «Чокай» был переведен в состав 5-го дивизиона.

Последние минуты «Начи». Нос оторван, корма отрывается и погружается в воду.

В тот же день в 8:20 над кораблями вице- адмирала Куриты появился американский разведывательный самолет с авианосца "Cabot” (CVL-28) Спустя два часа в 10:26 над головами японских моряков разверзлось небо. Вскоре после начала налета торпеда поразила правый борт «Миоко». Торпеда Мк 13 калибра 570 мм имела БЧ, содержащую 272 кг «торпекса». Такая торпеда поразила крейсер между шпангоутами №№ 248–250 в районе кормового машинного отделения № 4. Забортная вода тут же затопила отделение, а также соседнее генераторное отделение. Винты на правом борту остановились, максимальная скорость упала до 15 узлов. Поврежденный крейсер покинул строй, а командующий дивизионом перешел на борт «Хагуро». Все это произошло к востоку от острова Маэстре де кампо. Поврежденный крейсер получил приказ двигаться к заливу Колон. После временного ремонта и пополнении запасов топлива крейсер в сопровождении эсминца «Кисинами» и тральщика W 34 направился в Бруней (прибыл 29 октября). Затем, корабль направился в Сингапур.