В 1794 году его назначили директором Сухопутного шляхетского корпуса, на этом посту Кутузов воспитал много способных офицеров, которые впоследствии отличились в Отечественной войне 1812 года и других войнах Российской империи первой половины XIX столетия.
С 1795 года Михаил Илларионович был командующим и инспектором войск, расквартированных в Финляндии. В 1798 году Голенищев-Кутузов получил звание генерала от инфантерии. Успешно выполнил дипломатическую миссию в Пруссии, сделав её союзницей России против Франции. Был литовским и санкт-петербургским генерал-губернатором. В 1802 году Кутузов вызвал неудовольствие императора Александра I неудовлетворительным состоянием столичной полиции и, попав в опалу, попросился в отставку от службы. Три года он проживал в своём поместье, находясь не у дел.
Когда началась война с завоевателем Европы Наполеоном Бонапартом российский государь Александр I послал в 1805 году на помощь союзной Австрии две русские армии. Командовать одной из них он поручил генералу от инфантерии Кутузову. Пока его 50-тысячная армия находилась на марше, союзная австрийская армия потерпела полный разгром в сражении под Ульмом. Кутузов оказался один против превосходящих сил противника.
Тогда русский полководец совершил свой знаменитый отступательный марш-манёвр от Браунау к Ольмицу (Оломоуцу), чтобы не позволить французам окружить свою армию. В ходе манёвра русские разбили войска наполеоновских маршалов Мюрата под Аштеттином и Мортье под Дюренштейном. Этот марш вошёл в историю военного искусства как замечательный образец стратегического манёвра.
Вопреки мнению Кутузова император Александр I и австрийский император Франц I перешли в наступление на французскую армию. 20 ноября 1805 года состоялось Аустерлицкое сражение, в котором русский главнокомандующий оказался фактически отстранённым от командования войсками. Наполеон одержал под Аустерлицем одну из самых крупных своих побед. Александр I, прямой виновник поражения союзной русско-австрийской армии, вину за неё возложил на Кутузова, и тот снова оказался в опале.
Генерал от инфантерии был назначен киевским военным губернатором. В марте 1808 года ему поручили командовать корпусом Молдавской армии. Но из-за разногласий по поводу ведения боевых действий против турок в войне 1806-1812 годов и штурма крепости Браилов у Кутузова не сложились отношения с престарелым главнокомандующим генерал-фельдмаршалом А.А. Прозоровским, и Михаила Илларионовича назначили виленским военным губернатором.
Однако именно Кутузову пришлось победно завершить эту затянувшуюся Русско-турецкую войну, на которую в Париже возлагали большие надежды — император Наполеон I Бонапарт уже деятельно готовился к вторжению в Россию. В 1811 году, когда война с Турцией зашла в тупик, российский император назначил главнокомандующим Молдавской армией опального полководца. В Рущукском сражении, имея всего 15 тысяч войск, Кутузов нанёс сокрушительное поражение 60-тысячной султанской армии под командованием опытного полководца Ахмет-паши.
После одержанной победы он преднамеренно отвёл русскую армию за Дунай, в Валахию. За ним на противоположный дунайский берег устремился и неприятель, и 40 тысяч турок оказались блокированными русскими войсками в лагере под Слободзеей. Вскоре султанская армия сдалась «на сохранение» русскому главнокомандующему, и султан Махмуд II, лишившись цвета своего воинства, вынужден был заключить мир с Россией на выгодных для неё условиях.
Генерал от инфантерии М.И. Голенищев-Кутузов за победное окончание войны с Оттоманской Портой получил графский титул, но не вернул себе расположения императора. Александр I был недоволен действиями главнокомандующего Молдавской армией, и условиями заключённого Кутузовым (он обладал такими правами) мира с турками. Полководец снова был отстранён от командных должностей в русской армии.
В начале Отечественной войны 1812 года Михаила Илларионовича избрали начальником Санкт-Петербургского, а затем Московского ополчений. После того как русские войска оставили Смоленск, под давлением общественности император назначил Кутузова главнокомандующим всей русской действующей армией, уступив членам особого правительственного комитета.
Новый главнокомандующий прибыл в отступавшую к Москве русскую армию под Царёво-Займище. За два месяца отступления русская армия отошла от государственной границы более чем на 800 километров. До Москвы оставалось около 150. И всё же Кутузов решил отвести 1-ю и 2-ю Западные армии дальше, в глубь России. Он учитывал значительное превосходство наполеоновской Великой армии и отсутствие у своей армии подготовленных резервов. Пройдёт время, и историки назовут это его решение гениальным.
Не получив обещанных крупных подкреплений, Кутузов решает дать Наполеону Бонапарту генеральное сражение, выбрав для этого удобную позицию. Ею стало огромное поле у деревни Бородино. Состоявшаяся здесь 26 августа Бородинская битва развеяла миф о непобедимости императора-полководца Наполеона.
Наполеон привёл под Бородино 135 тысяч солдат при 587 орудиях. В его распоряжении были войска почти половины Европы. Русская же армия в Отечественной войне 1812 года не имела ни одного союзника и насчитывала 120 тысяч человек, из них 10 тысяч ополченцев, в боях не участвовавших, 7 тысяч казаков и 640 орудий.
Готовясь к сражению с сильнейшей европейской армией, Кутузов умело воспользовался природными особенностями избранной им позиции на Бородинском поле. Она защищала основные дороги, ведущие к Москве (Наполеон задумал поразить Россию в сердце). Её фланги нельзя было обойти, так как они прикрывались: справа рекой Москвой, а слева — густыми лесами. Позиция возвышалась над местностью и была очень удобной для артиллерии. Реки и овраги, находившиеся с фронта, мешали французской армии свободно маневрировать.
На рассвете 26 августа свыше ста французских орудий открыли шквальный огонь по Багратионовым флешам. Наполеоновские войска, ведомые лучшими маршалами Франции, пошли в наступление.
В этом сражении ни одна из сторон не добилась решающего перевеса. К концу дня бородинская позиция оставалась в руках русской армии. С наступлением темноты император Наполеон приказал своим войскам оставить поле брани и разрушенные укрепления противника и вернуться на исходные позиции.
В донесении императору Александру I главнокомандующий М.И. Голенищев-Кутузов докладывал: «Сражение было общее и продолжалось до самой ночи. Потеря с обеих сторон велика: урон неприятельский, судя по упорным его атакам на нашу укреплённую позицию, должен весьма нашу превосходить. Войска русские сражались с неимоверною храбростию: батареи переходили из рук в руки, и кончилось тем, что неприятель нигде не выиграл ни на шаг земли с превосходными своими силами».
Бородино дорого обошлось Наполеону. Его армия потеряла убитыми и ранеными более 50 тысяч человек, или свыше 43 процентов своего состава! А французская кавалерия, самая сильная в Европе, — 57 процентов! Из строя выбыло 47 наполеоновских генералов. Но и потери русской армии оказались весьма значительными. На Бородинском поле М.И. Кутузов добился главного — разрушил стратегию Наполеона Бонапарта, основанную на победе в генеральном сражении.
Кутузов добился в сражении трех главных результатов:
• Во-первых, французской армии не удалось сломить сопротивление русской, разгромить её в генеральной баталии и открыть себе свободный путь к Москве.
• Во-вторых, русская армия вывела из строя почти половину противостоявшей ей в битве наполеоновской Великой армии.
• И, наконец, в третьих, на Бородинском поле французская армия понесла невосполнимый моральный ущерб, в то время как у русских войск возросла уверенность в победе.
За Бородинское сражение М.И. Голенищев-Кутузов получил звание генерал-фельдмаршала.
После битвы в подмосковной деревне Фили состоялся военный совет, на котором решались два вопроса: давать ли под стенами русской столицы ещё одно генеральное сражение французам, или без боя оставить Москву. Главнокомандующий понимал, что русские войска после Бородинской битвы были не в состоянии выдержать в ближайшее время ещё одно подобное сражение. «С потерею Москвы не потеряна Россия», — сказал он.
