7 июня 1988 года ПЕТЕРБУРГ в усиленном составе (плюс гитарист Андрей Мерчанский из ПРИИСКА, флейтист Андрей «Доктор» Соколов и аж три бэк-вокалистки из числа слушательниц рекшановского семинара) удачно для себя отметился на VI фестивале Рок-клуба. Тем же летом объединение «Видеофильм» отсняло полнометражный телефильм, посвященный судьбе группы. В период 1988–1989 годов САНКТ-ПЕТЕРБУРГ давал концерты дома, гастролировал и записывался. Так и прописавшегося в DDT Зайцева сменил Мерчанский.
В 1988-м Корзинин и Зайцев возродили идею БОЛЬШОГО ЖЕЛЕЗНОГО КОЛОКОЛА под названием НЕПРИКОСНОВЕННЫЙ ЗАПАС, записав с ним альбом и удачно выступив на фестивале журнала «Аврора» (1989). Рекшан в этот период все свое время посвящал литературе.
В январе 1990 года Рекшан с группой сессионных музыкантов – Вадим Блейзизен (ПАУТИНА), гитара, Василий Соколов (ПРИИСК), бас, Антон Антонов (ПРИИСК), клавишные, и Геннадий Аржаев (ГЕНЕРАТОР БЕЛОГО ШУМА), барабаны – записал саундтрек к художественному фильму «Панцирь».
Вскоре после этого Рекшан восстановил партнерство с Корзининым и собрал осовремененную версию САНКТ-ПЕТЕРБУРГА, в которую рекрутировал Василия Соколова из распавшегося к тому времени ПРИИСКА. Их гитаристами в разное время числились Сергей Донов (экс-КАЛЕНДАРЬ), Стас Веденин (экс-ЛЕТНИЙ САД, позже ЖИВАЯ РЫБА), Николай и Сергей (позднее ТЕЛЕВИЗОР) Богдановы и т. д.
В октябре 1991 года САНКТ-ПЕТЕРБУРГ выступил на фестивале «Европа + Азия» в Челябинске. К этому времени в его составе появился клавишник Сергей Рудашевский, по инициативе которого новым гитаристом стал его знакомый Сергей Степанов-Рудзинский (ранее БУРАТИНО-БЭНД). Этим составом с марта по май 1993-го САНКТ-ПЕТЕРБУРГ записал первую в своей истории студийную работу, «Коллекционный альбом '69–'94», на следующий год выпущенный на компакт-диске. Он включал как старые хиты группы, так и несколько новых номеров.
В конце 1993 года Рудашевский и Степанов, которые до этого некоторое время репетировали собственную англоязычную программу, ушли и собрали группу JET FIGHTERS (позднее JACK DANIELS).
В середине 90-х активность САНКТ-ПЕТЕРБУРГА заметно снизилась: Корзинин играл с группой ХРАМ МИРА, которая взяла в свой репертуар ряд его песен; Ковалев стал жертвой рассеянного склероза, приковавшего его к постели; Зайцев работал в DDT и выступал в джаз-клубах с собственной программой; Рекшан целиком посвятил себя писательскому ремеслу: его перу – помимо упомянутого выше «Кайфа» – принадлежат сборники рассказов «Третий закон Ньютона» (1987) и «Сестра таланта» (2001), множество статей в периодике, романы и повести «Время тяжелой реки» (1991), «Смерть в до мажоре» (1994), «Ересь» (1995), «Четвертая мировая война» (1996), «Смерть в Париже» (1997), «Царские кости» (2000), «Ужас и страх» (2004) и т. д.
Братья Лемеховы, покинув сцену, добились профессионального признания как архитекторы и художники-иллюстраторы. Лызлов сделал блестящую карьеру на научной ниве – к сожалению, в начале 90-х при трагических обстоятельствах он ушел из жизни. Матусов преподавал, а в первой половине 80-х выступал с группами ОЗЕРО и ЗЕНИТ. Марский до настоящего времени живет в США.
В августе 1996 года участники разных версий группы (Рекшан, Корзинин, Веденин, Богданов) и сессионные музыканты (Дюша Романов из ТРИЛИСТНИКА, Александр Храбунов из ЗООПАРКА, Евгений «Жак» Волощук и Юрий Ключанцев из ПИКНИКА и др.) записали альбом «Лирика капитализма», вскоре выпущенный на кассетах. Он включал материал 80-х и 90-х, а также новое прочтение исполнявшейся еще классическим САНКТ-ПЕТЕРБУРГОМ песни «Если вас спросят». Волощук, который был основателем ПИКНИКА и когда-то играл в ГОРОДЕ Mk 2, с тех пор стал непременным бас-гитаристом группы.
В 1996–1997 годах старые и новые участники САНКТ-ПЕТЕРБУРГА собрались, чтобы в современных условиях восстановить на студии «АнТроп» музыкальные архивы группы, составившие ни много ни мало пять альбомов! Один из них, под названием «Классика», был позже выпущен Андреем Тропилло; а остальные до настоящего времени ждут своего издателя.
30 января 1998 года САНКТ-ПЕТЕРБУРГ выступил в бывшем Рок-клубе на концерте рок-ветеранов вместе с MOBY DICK, старым ПИКНИКОМ и группой ОДА Сергея Болотникова (в середине 80-х гитарист ГОРОДА). В декабре того же года они приняли участие в еще одном ностальгическом шоу «Старый рок под Новый год», организованном в ДК им. Дзержинского барабанщиком АРГОНАВТОВ Владимиром Калининым и автором этих строк.
Летом 2000 года САНКТ-ПЕТЕРБУРГ понес невосполнимую утрату: 24 августа от комы печени умер Никита Зайцев, который в конце 90-х после непродолжительного перерыва вернулся в DDT, а также играл и записывался с Чижом, ПОЛКОВНИКОМ И ОДНОПОЛЧАНАМИ и т. д. Он участвовал в записи «Классики» и оставил после себя незаконченный соло-альбом.
В октябре 2000-го САНКТ-ПЕТЕРБУРГ отметился на двадцатилетии Ленинградского Рок-клуба во Дворце спорта «Юбилейный», а в декабре того же года фирма «Фоно» издала сборник записей разных лет с непритязательным (зато говорящим) названием «Лучшее 1970–2000».
Летом 2001-го Рекшан и Корзинин в очередной раз реформировали группу, в ряды которой были вновь призваны гитарист Николай Богданов (участник составов первой половины 90-х) и уже проверенный на практике Евгений Волощук.
После того как третье тысячелетие вступило-таки в свои права, поколению рок-н-ролла пришлось столкнуться с неотвратимой эпидемией юбилеев. Хотя сам Рекшан свою полувековую дату специально не отмечал, в ноябре 2001 года они с Колей Богдановым дуэтом выступили на пятидесятилетии сооснователя МИФОВ Сергея Данилова, а три недели спустя участники САНКТ-ПЕТЕРБУРГА разных эпох (включая братьев Лемеховых) встретились на сцене, чтобы поздравить с круглой датой Николая Корзинина.
В этот период Рекшан начал тесно сотрудничать с Фондом свободной культуры «Пушкинская, 10»: вместе с одним из руководителей фонда, врачом Николаем Медведевым, они учредили институт петербургского гражданства и даже начали выдавать свидетельства об этом всем, кто разделял их взгляды; кроме того, с января 2002 они начали проводить приуроченные к этому концерты на сцене расположенного в помещениях фонда клуба «Fishfabrique», на которых играли, как правило, молодые группы, а также сам САНКТ-ПЕТЕРБУРГ: в апреле 2002-го к Рекшану, Корзинину и Жаку присоединились Игорь Бобер (ЛИНИЯ МАННЕРГЕЙМА, Женя ГЛЮКК И ГРУППА ПРИКРЫТИЯ), гитара, и Дмитрий Самусенко (ПОЛЕ ЧУДЕС, ЖИВАЯ РЫБА, ЗИГЗАГ), гитара, звук.
Для выступления на II фестивале «Окна Открой!» в июне 2002 года Рекшан привлек к сотрудничеству группу ЛЕНИЧ-BAND в полном составе: Леонид «Ленич» Синцов (экс-АКУСТИКА), соло-гитара, Олег Миронов (экс-THE SODS), бас, Анастасия Бартенева, клавишные, и Илья Ивахнов (экс-THE SODS, АКУСТИКА), барабаны. В тот же период группа обзавелась своим представительством в Интернете.
Альянс с ЛЕНИЧ-BAND закончился осенью, поэтому на третьих «Окнах» (в июне 2003 года) состав ПЕТЕРБУРГА опять был старо-новым: Рекшан, Корзинин, Волощук, Самусенко, Ивахнов плюс клавишник Александр Молчанов (экс-THE SODS). Той же осенью под новым лэйблом Андрея Тропилло «Антропос» был выпущен довольно неожиданный по содержанию альбом Рекшана и САНКТ-ПЕТЕРБУРГА «Революцiя» – в нем мэтр и живой классик перепел в своих аранжировках популярные песни времен революции и Гражданской войны.
Практически тем же составом группа выступила и на четвертых «Окнах» (июнь 2004-го), однако после этого в ее жизни наступило определенное затишье: к этому времени Самусенко занялся делами своей студии «Самурай» и работой над своим первым соло-альбомом; Ивахнов ушел в Оркестр ЗАЧЕМ, а Молчанов играет в кавер-бэндах. Сам Рекшан был избран председателем общества по охране авторских прав, учрежденного Андреем Тропилло (которого Рекшан вывел под различными именами в ряде своих романов).
В июне 2005 года наш мир покинул бас-гитарист классического ПЕТЕРБУРГА Виктор Ковалев. В ближайшие годы «АнТроп» планирует переиздать на компакт-дисках все архивные записи группы и соло-альбом Николая Корзинина.