Однако времени на создание нелегальных звеньев внешней разведки, обучение ее персонала работе на рации, закрепление этих навыков не хватило.
2 июля 1941 года А.М. Коротков вместе с интернированным составом посольства покинул Германию. В турецком городе Эдирне советские сотрудники были переданы немцами представителям турецких властей и сотрудникам советского посольства в Турции. Через несколько дней Александр Михайлович Коротков был уже в Москве.
В августе 1941 года Коротков был назначен заместителем начальника немецкого отдела ГУГБ НКВД. В ноябре он уже стал начальником отдела, на который во время войны было возложено ведение разведывательной работы на территории Германии, Польши, Чехословакии, Венгрии, Болгарии, Румынии, Югославии, Греции.
Положение Короткова как начальника отдела было чрезвычайно сложным. Связь со многими источниками в Германии была с началом войны потеряна. Война с Германией сделала невозможным пребывание «легальных» резидентур в тех странах, которые выступили союзниками Гитлера против СССР (кроме Болгарии). В результате репрессий 1937–1938 годов из Германии и других европейских стран были отозваны разведчики-нелегалы. Многие из них были репрессированы.
А.М. Короткову приходилось прилагать в этих условиях огромные усилия, чтобы по сути дела воссоздать агентурный и нелегальный аппарат, решать возникающие сложные задачи, налаживать взаимодействие с соответствующими подразделениями НКВД, а в некоторых необходимых случаях и с Разведупром РККА. Он лично участвовал в подборе людей, особенно если речь шла о важных операциях, контролировал их подготовку, проводил отдельные занятия, отдавал распоряжения по обеспечению курсантов соответствующими документами, а затем обеспечивал их заброску в тыл противника. Все это делалось в сжатые сроки, которые сейчас кажутся фантастическими.
Немало агентурных групп, подготовленных под руководством Александра Михайловича, успешно выполняли задания в тылу противника.
Для переброски разведчиков в Германию и соседние с нею страны использовался также метод внедрения агентуры в среду трудоспособного населения, вывозившегося в Германию из оккупированных советских территорий. Для этого через возможности действовавших в тылу противника оперативно-разведывательных отрядов подбирались надежные люди, имевшие ходовые рабочие специальности, проходили в отрядах короткую спецподготовку, а затем вербовались на работы в Германию.
Ряд мероприятий по переброске и документированию нелегалов осуществлялся в контакте с английскими спецслужбами. Подготовленные в возглавляемом А.М. Коротковым отделе нелегалы стали прибывать в Англию в начале 1942 года. Здесь их размещали на конспиративных квартирах, обеспечивали соответствующей экипировкой, документами и затем перебрасывали на территорию Германии и в оккупированные ею европейские страны. За время войны на вражескую территорию было заброшено таким путем около двадцати разведчиков. Однако следует отметить, что, несмотря на огромную работу по задействованию этого контингента, положительных результатов получено не было. Заброшенные в тыл противника разведчики бесследно исчезли, установить их судьбу не удалось.
Коротков часто бывал на фронте, где на месте решал острые оперативные задачи.
После освобождения Румынии, Польши и Югославии Коротков выезжал в эти страны для того, чтобы на месте детально разобраться в складывающейся военно-политической обстановке и организовать постоянное информационное освещение непростой политической ситуации в этих государствах.
К концу войны на территории Германии уже действовало несколько оперативных групп, которые снабжали информацией руководство страны и командование Красной Армии. По завершении войны оперативные группы, действовавшие на территории Германии, были объединены. В результате создалась первая послевоенная резидентура внешней разведки под прикрытием Аппарата политического советника при Главнокомандующем советской военной администрации в Германии. Первым резидентом берлинской резидентуры в октябре 1945 года был назначен Александр Михайлович Коротков.
Вот как иногда случается в жизни. Здесь, в Берлине, в должности заместителя резидента Александр Михайлович встретил тревожные дни начала войны 1941 года. Он твердо верил тогда, что мы победим, но и понимал, что впереди тяжелые, кровопролитные годы борьбы. Теперь, после победы, он снова в Берлине и в той же резидентуре, но уже в качестве ее резидента. Смешанные чувства одолевали его. С одной стороны, радость победы, а с другой — тяжелый груз на сердце, горечь утрат боевых друзей, неизвестность судьбы многих, кого знал и кто выполнял боевые задания за линией фронта. А сколько тревог пришлось пережить Короткову, когда заброшенный в тыл противника разведчик долго не выходил на связь. Немало было случаев, когда эти храбрые ребята так и не дали о себе знать.
По официальной должности прикрытия Александр Михайлович был заместителем политсоветника. Положение позволяло ему часто общаться с маршалом Г. К. Жуковым. Маршал почти всегда принимал вне очереди полковника Короткова, хотя в приемной постоянно было много посетителей, поскольку был уверен, что услышит от Александра Михайловича важные новости, которые он ежедневно докладывал Главнокомандующему. Информация действительно была исключительно важной, а иногда и весьма срочной.
Жуков с уважением относился к Короткову за его аккуратность, подтянутость, осведомленность, надежность и достоверность поступавшей от него информации. Порой данные поступали из таких сфер, что однажды маршал не удержался и спросил:
— Как же вам удалось забраться туда?
— А что делать, товарищ маршал, — с нарочитой серьезностью отвечал Александр Михайлович, — волка ноги кормят.
Жуков усмехнулся и сказал:
— Это правильно, волка кормят ноги, но разведчику, как я понимаю, к ногам нужна еще и хорошая голова. Верно говорю?
— Совершенно справедливо, товарищ маршал.
И оба рассмеялись.
Александр Михайлович проработал в Берлине до конца 1946 года. За это время была налажена работа резидентуры, развернута активная деятельность на территории советской и западных оккупационных зон. Были восстановлены связи с некоторыми источниками довоенного периода, приобретено значительное число новых.
Резидентура провела ряд ответственных операций по поиску и изъятию секретных документов гитлеровских спецслужб, технической документации КБ и заводов, занимавшихся разработкой и выпуском новейших образцов оружия, получению образцов новой техники и информации о современных технологиях.
По возвращении в Москву Коротков был назначен начальником одного из подразделений внешней разведки. Большое внимание он уделял организации разведывательной работы с нелегальных позиций. Война показала, насколько важно иметь надежную сеть нелегалов. Александр Михайлович спешил претворить бесценный опыт в жизнь. В этот период все отчетливее стали проявляться признаки развертывания холодной войны. В руки разведки стали попадать документы, которые свидетельствовали о наличии на Западе планов прямого военного нападения на Советский Союз.
Александр Михайлович отчетливо понимал, что в период военных действий или крупномасштабных кризисных ситуаций разведывательную работу эффективно вести можно только с нелегальных позиций. В этот период был сделан значительный шаг и в плане теоретических разработок, и на путях более широкого практического применения нелегальных форм работы. Заслуга А.М. Короткова в этом огромна.
Летом 1957 года генерал-майор Коротков был назначен уполномоченным КГБ при СМ СССР по координации и связи с МГБ и МВД ГДР. На его плечи легло руководство самым крупным подразделением советской разведки за границей, ориентированным на ведение активной разведывательной работы по НАТО. Помимо этого, аппарат осуществлял сотрудничество с органами безопасности ГДР, оказывал непосредственную помощь советским военным разведывательным службам, действовавшим с территории ГДР.
Способный организатор, творчески мыслящий руководитель, Коротков провел большую работу по структурному совершенствованию аппарата, повышению эффективности его работы, укреплению кадрового состава.
