Через месяц после переворота под руководством Сийеса была написана новая конституция. Но когда Сийес представил Бонапарту её проект, по которому первый консул должен был играть роль верховного представителя страны, а управлять должны были другие, лишь назначаемые им, но от него не зависящие люди, Бонапарт заявил: «Я никогда не стану играть такой смешной роли». Наполеон подверг проект коренной правке и кардинальным исправлением. Из него были изъяты остатки демократических свобод. Вся полнота власти сосредоточилась в руках первого консула. Два остальных имели лишь совещательный голос. Консулы назначали членов Сената, а те утверждали членов Законодательного корпуса и Трибуната из числа нескольких кандидатов, избираемых населением. 25 декабря 1799 г. был проведен плебисцит, утвердивший новую конституцию и трёх консулов. Вскоре после этого из 73-х существовавших газет было закрыто 60, а остальные были поставлены под суровый надзор министра полиции.
Гораздо более, чем свобода слова, французов волновали тогда насущные проблемы: гражданская война на западе страны и невероятно развившийся бандитизм в южных и центральных департаментах. Бандитизм приобрел характер страшного социального бедствия. Огромные шайки не только разбойничали на дорогах, но и совершали налеты на города. Полиция была совершенно бессильна против этого зла. Став первым консулом, Бонапарт двинул против разбойников армию. Приказано было не брать бандитов в плен, но расстреливать на месте без всякого суда. С той же суровостью карались местные власти, изобличенные в связях с преступниками или виновные в попустительстве. Уже через полгода с разбоями было покончено. Гражданскую войну в Вандее Бонапарту не удалось прекратить полностью, но он значительно ослабил её силу. Всем замешанным в мятеже была объявлена амнистия, а гонения на католическую церковь прекращены. Одновременно усилено было военное давление. Разбитые в нескольких сражениях шуаны перешли к партизанской борьбе.
От Вандеи Наполеон обратился к финансам. От Директории ему досталась пустая казна. Несмотря на высокие налоги, деньги почти не поступали. Между тем к весне предстояло снарядить новую большую армию и вести войну со всей Европой. Суть финансовой политики Наполеона сводилась к тому, что прямые налоги были заменены косвенными. Вместе с тем был установлен строгий контроль за отчетностью и начата беспощадная борьба с казнокрадами. Одновременно была проведена кардинальная реформа местного управления. Все выборные должности и собрания были упразднены. Отныне министр внутренних дел назначал в каждый департамент префекта, который делался его владыкой и повелителем. Префект в свою очередь назначал муниципальные советы и городских мэров. Особое внимание было уделено министерству полиции. Вообще полицейское дело при Бонапарте было поставлено на такую высоту, какой Франция ещё не знала. Заведено было несколько полиций, которые следили друг за другом и помогали Наполеону чутко улавливать все изменения, происходившие в народном сознании.
Не осталась без внимания и светская жизнь. В это время вокруг семейства Бонапартов сложилось новое высшее общество. В отличие от времен Директории первую роль в нём играли блестящие военные. Люксембургский дворец, который был официальной резиденцией директоров, показался Наполеону слишком маленьким. Через три месяца он перенес своё местопребывание в Тюильри. При этом был извлечен из забвения придворный этикет. Наполеон облачился в пышный костюм из красного бархата. Консульская гвардия отдавала ему салют как королю. Жозефина вновь ввела в обиход слово «мадам», чем сильно расстроила республиканцев, но Наполеон пошел ещё дальше, официально приказав именовать себя «ваше высочество». Все члены семейства Бонапартов обзавелись прекрасными загородными домами, в которых постоянно было полно гостей. Веселые прогулки, Декламации, бильярд, литература стали здесь обычным времяпрепровождением. Раскрепощенность и свобода предавали этим собраниям неповторимое очарование.
Окончив самые неотложные дела, Бонапарт уже 8 мая 1800 г. покинул Париж и отправился на новую большую войну. Главным противником его по-прежнему были австрийцы, которые после ухода Суворова вновь заняли Северную Италию. Австрийский главнокомандующий Мелас ожидал, что Наполеон поведет свою армию вдоль побережья, как и в первый раз, и здесь сосредоточил свои войска. Но Наполеон избрал самый сложный путь – через Альпы и перевал Сен-Бернар. 16 мая начался подъем в горы, а 21-го сам Бонапарт с главными силами был на Сен-Бернаре. Слабые австрийские заслоны были опрокинуты, и в конце мая вся французская армия внезапно вышла из альпийских ущелий и развернулась в тылу австрийских войск. 2 июня Наполеон занял Милан. Мелас поспешил навстречу противнику, и 14 июня у деревушки Маренго произошла встреча главных сил. Все преимущества были на стороне австрийцев. Против 20 тысяч французов они имели 30 тысяч, преимущество в артиллерии было вообще почти десятикратным. Поэтому начало битвы сложилось неудачно для Наполеона. Французы были вытеснены со своих позиций и отступали с большими потерями. Но в четвертом часу подоспела свежая дивизия Дезэ, ещё не участвовавшая в битве. Прямо с марша она вступила в бой, а за ней пошла в атаку вся армия. Австрийцы не выдержали натиска и обратились в бегство. Уже в пятом часу армия Меласа была наголову разбита. Торжество победителей было омрачено только смертью Дезе, который погиб в самом начале атаки. Узнав об этом, Наполеон плакал первый раз в жизни. Этой победой война была фактически завершена. Уже в конце 1800 г. был решен вопрос о мире с Россией. 9 февраля 1801 г. закончились мирные переговоры с Австрией. По Люневильскому миру от неё были отторгнуты остатки Бельгии, Люксембург и все германские владения по левому берегу Рейна. Австрия признала Батавскую республику (Голландию), Гельветическую республику (Швейцарию), а также Цезальпинскую и Лигурийскую республики (Геную и Ломбардию), которые оставались фактически французскими владениями. Наконец, 26 марта 1802 г. в Амьене был подписан мирный трактат с Англией, положивший конец тяжелой девятилетней войне Франции против всей Европы.
