Сигизмунд едва успел спастись бегством на большой лодке. В устье Дуная его встретили венецианские корабли и доставили в Константинополь. Оттуда он переправился в Далмацию. В его королевстве царила анархия: турки совершили набег на Венгрию, в то же время против Сигизмунда поднял мятеж воевода Стефан Лацкович. С величайшим трудом и опасностями король добрался до Буды, где провел несколько следующих лет, борясь с волнениями, раздиравшими страну, и только усиливая их своими жестокостями. В 1401 г., воспользовавшись отъездом короля в Польшу, многие магнаты заключили между собой союз и договорились, свергнув Сигизмунда, выбрать себе другого короля. Вождем их был Янош Капижай, архиепископ Гранский. Узнав о замысле заговорщиков, Сигизмунд поспешно возвратился в Офен. Вельможи собрались во дворце под предлогом свидания с королём, перечислили ему его противозаконные поступки и злодейства, а затем объявили, что арестуют его. Он был отвезен в Вышеград и отдан под стражу. Если бы магнаты могли согласиться в том, кого выбрать королём, а Владислав Неаполитанский приехал в Венгрию, Сигизмунд был бы низложен. Но противники долго спорили между собой. Тем временем приверженцы короля успели собрать войска и одержали победу в нескольких стычках. Наконец, был заключен мир, и Сигизмунд вышел на свободу.
В это время перед ним открылись новые возможности: его старший брат Венцеслав был лишён немецкими курфюрстами императорской короны, осажден в Праге и согласился назначить Сигизмунда регентом в Чехии. Едва выйдя на свободу и примирившись со своими противниками, он поспешил завладеть страной брата, хотя с трудом удерживался в своей собственной. В Чехии Сигизмунд нашел те же мятежи, заговоры и неповиновение вельмож, к каким успел привыкнуть в Венгрии. Чтобы брат не мешал ему, Сигизмунд в марте 1402 г. велел арестовать Венцеслава и выслать в Австрию. В конце 1403 г. тот бежал из-под стражи и был радостно встречен в Чехии. В 1404 г. Сигизмунд пошел против брата, осадил Знаим, но в войсках его началась повальная болезнь. Потеряв много людей, он отступил. На некоторое время Сигизмунд должен был удовлетвориться своим прежним королевством и занялся устройством венгерских дел. Страна была утомлена многолетними волнениями. Все жаждали мира, и Сигизмунд впервые за 15 лет получил возможность оказать услугу своему новому отечеству. Он продолжил начатое Людовиком Великим дело организации войска и старался распределить воинскую повинность со всевозможной справедливостью между всеми сословиями. Во многих городах были поставлены гарнизоны для отражения внезапных нападений турок. Эти гарнизоны составляло низшее дворянство. Оно было теперь переведено из-под начальства жупанов на службу непосредственно под знамена короля и образовало нечто подобное постоянному войску. Опираясь на эти части, Сигизмунд заметно увеличил своё могущество. Другую опору против магнатов король нашел в городах. В 1405 г. он впервые пригласил на сейм депутацию от городов и с согласия всех сословий дал сейму новое устройство, так что это собрание сделалось из дворянского национальным. Сигизмунд увеличил число городов, пользовавшихся самоуправлением, и дал крестьянам право селиться в них. Были установлены строгие законы против грабежей и самоуправства; благодаря этому, а также из-за согласия, которое установилось между королём и магнатами, в стране воцарилось спокойствие. Собрав силы, Сигизмунд в следующие годы вновь покорил Кроацию, отобрал обратно у венецианцев Далмацию и подавил восстание в Боснии.
Имей Сигизмунд больше времени заниматься венгерскими делами, он, наверно, мог бы сделаться хорошим государем. Но он был слишком беспокойным человеком для того, чтобы довольствоваться имеющимся, и постоянно мечтал о расширении своей власти. Обстоятельства, казалось, благоприятствовали ему. В мае 1410 г. умер император Рупрехт. Курфюрсты, собравшиеся на выборы его преемника, заранее уговорились выдвинуть его только из Люксембургской династии. Выбор, собственно, шёл между Сигизмундом и его двоюродным братом Йобстом, причем часть курфюрстов избрала одного, а часть – другого. Однако в январе Йобст внезапно скончался. Низложенный десятью годами раньше Венцеслав согласился передать брату императорские полномочия и помирился с ним. Таким образом, Сигизмунд был единодушно провозглашен императором.
Несколько лет после своего избрания он никак не находил возможности приехать в Германию на свою коронацию, так как не имел денег на путешествие и не мог отделаться от окружавших его врагов. В 1411 – 1413 гг. Сигизмунд вел упорную войну с венецианцами из-за далматских и ломбардских областей. Осенью 1413 г. он явился в Ломбардию, но имел мало войск и принужден был вернуться. Тогда же он встретился с папскими послами и условился с ними о созыве церковного собора в Констанце. Этот собор, как надеялись все благоверные католики, должен был положить конец разрушительному церковному расколу, продолжавшемуся уже много лет (в это время было три папы: один – в Италии, другой – во Франции, третий – в Испании; каждый из них изрекал проклятья на своих противников и на приверженные им страны).
Осенью 1414 г. Сигизмунд приехал, наконец, в Германию и был торжественно коронован в Ахене. Затем он поспешил в Констанцу, где уже начались заседания собора. С самого начала собор изъявил намерение, для совершенного искоренения зла, отрешить всех трёх пап, а потом избрать нового. Иоанн XXIII, единственный из всех пап, приехавший в Констанцу, должен был согласиться с единодушным мнением депутатов. 1 марта 1415 г. он торжественно отрекся от своего сана. Одним из последних дел этого папы стала организация процесса против знаменитого чешского проповедника Яна Гуса. Гус сурово порицал в своих проповедях пороки католического духовенства и требовал церковной реформы в духе учения Уиклифа. Сигизмунд пригласил Гуса приехать на собор и дал ему охранную грамоту. Тем не менее Гус в Констанце был арестован, предан суду, приговорен к смерти и сожжен 6 июля 1415 г. Расправа с ним потрясла всех чехов и навсегда сделала Сигизмунда их врагом.
