Между тем вслед за Иоанном добровольно сложил с себя папский сан Григорий XII, живший в южной Италии. Но Бенедикт XIII, находившийся в Испании, был совсем не расположен к уступкам. Сигизмунд полагал, что добьется исполнения воли собора, если лично переговорит с ним и его покровителем арагонским королём Фердинандом. В сентябре король с блестящей свитой приехал в Перпи-ньян. Переговоры его с Бенедиктом долго оставались безуспешными, так как упрямый старик отказывался сложить с себя сан. Но король Фердинанд внял доводам императора и перестал поддерживать Бенедикта. В декабре третий папа тоже был низложен. Очень гордый этим успехом, Сигизмунд решил своим посредничеством прекратить войну между Англией и Францией. Из Нарбоны он отправился в Париж, а потом в Лондон, но ни в одной из столиц его посредничество не имела успеха. Растратив на эту бесцельную поездку около полутора лет, Сигизмунд в начале 1417 г. вернулся в Констанцу. Здесь короля ждали новые споры.
После низложения Бенедикта кардиналы стали требовать избрания нового папы. Сигизмунд и немецкие епископы долго возражали им и настаивали, что прежде надо провести церковную реформу. Но они оказались в меньшинстве и после долгих пререканий согласились начать процедуру выборов. В ноябре новым папой был избран кардинал Отто Колонна, принявший имя Мартина V. Этот ловкий и чрезвычайно умный папа сумел вскоре рассорить между собой сторонников реформирования церкви. В ноябре 1418 г. Констанцский собор разошелся, так и не проведя церковной реформы.
Едва приняв власть, новый папа повел борьбу против еретиков и в особенности грозил чехам, среди которых было много сторонников преобразований. Вся Чехия уже была охвачена восстанием. В Праге и во многих других городах гуситы разгромили католические церкви и монастыри. Радикальные гуситы под предводительством Яна Жижки построили крепость на горе Табор. В короткое время Жижка создал из охваченных религиозным энтузиазмом поселян сильную и чрезвычайно боеспособную армию Сигизмунд, который должен был наследовать в 1419 г. после смерти брата престол, поспешил в Чехию и созвал на Рождество богемский сейм в Брюнне. Но сюда приехали только умеренные гуситы – представители городов и знати. Они просили короля оградить их от свирепости таборитов (радикальных гуситов, сторонников Яна Жижки). Сигизмунд мог ещё найти поддержку в умеренной партии, но вместо этого обошелся с депутатами очень сурово и всячески третировал их как еретиков (во время первой аудиенции чехи должны были на коленях ожидать ответа короля и слушать сыпавшиеся на них ругательства и упреки). Сигизмунд потребовал, чтобы чехи разрушили пражские укрепления и удалили с правительственных должностей всех еретиков. Из Брюнна он отправился в Бреславль. 32 человека были приговорены к смертной казни, и в марте 1420 г. им всем в присутствии короля отрубили головы. Папа Мартин приветствовал твердость, с какой король взялся искоренять ересь. Тогда же он обнародовал буллу, провозглашавшую крестовый поход на гуситов. Ничего, кроме возмущения, эти меры не произвели. Даже многие чешские вельможи с негодованием уехали от короля. В начале апреля пражане объявили Сигизмунда низложенным и открыли ворота Яну Жижке и его таборитам. С этого времени противоречия между умеренными и радикальными гуситами стушевались. Вся нация объединилась для отпора немцам. Проповедь крестового похода привела к Сигизмунду многих рыцарей со всей Германии Кроме того, он вызвал в Чехию множество венгров и моравов. В июне король подступил к Праге со 100-тысячным войском и начал осаду. Несколько раз он предпринимал общий штурм, однако каждый раз крестоносцы были отбиваемы с большим уроном. В середине июля чехам удалось поджечь построенные из сухого дерева и кустарника шалаши осаждавших, так что пожар истребил большую часть их лагеря. После этого крестоносцы с позором отступили.
Сигизмунд был глубоко унижен неудачей крестового похода. В октябре 1421 г. с многочисленным венгерским войском и сильным австрийским отрядом, он пошел в Моравию и овладел ею без всякого сопротивления. Жижка ждал врага в укреплений под Куттенбергом. Сигизмунд долго осаждал его стан, но все его усилия опрокинуть таборитов не привели ни к чему. Когда у Жижки кончились припасы, он ушел из-под Куттенберга, но в январе 1422 г. внезапно вернулся и напал на короля. Сигизмунд в беспорядке отступил к Немецкому Броду и здесь потерпел новое сокрушительное поражение. Жижка захватил знамена, обоз и преследовал Сигизмунда до Иглавы.
После этого король в течение нескольких лет был занят венгерскими делами и войной с турками. Германия была предана своей судьбе. Здесь царила анархия. Между тем гуситы совершали опустошительные набеги на соседние земли и одержали несколько больших побед над немецкими князьями. Уже на склоне своих дней, в 1432 г., Сигизмунд отправился в Рим для получения императорской короны.
У него не было ни войск, ни денег. Флорентийцы осадили его в Сиене и продержали в осаде целый год. Впрочем, Сигизмунд приятно проводил время, потому что в городе нашлось множество красавиц, охотно даривших ему свою любовь. Только в мае 1433 г. он добрался до Рима и на праздник Троицы был увенчан императорской короной.
С чехами Сигизмунд больше не отваживался воевать и вел с ними бесконечные переговоры. Страна была охвачена гражданской войной. После нескольких кровопролитных битв табориты потерпели поражение, к власти пришла умеренная партия гуситов. В марте 1435 г. чешский сейм изложил условия, на которых Сигизмунд мог занять престол. Ради получения королевской власти Сигизмунд охотно пошел на уступки и обещал все, что у него просили. В августе 1436 г. он приехал в Прагу. Народ приветствовал его. Но вскоре сделалось очевидным, что император не собирается исполнять своих обещаний. Он открыто покровительствовал католикам, помогал им восстанавливать храмы и монастыри, не допускал на важные государственные посты твердых в своей вере гуситов, отнял всякую власть у пражского архиепископа, стал раздавать должности иноземцам и не заботился о соблюдении прав. Возмущение стало вновь охватывать страну. Однако император умер прежде, чем открытое недовольство успело прорваться наружу. Незадолго до своей кончины он передал власть над Венгрией и Чехией своему зятю Альберту Габсбургу, герцогу Австрийскому. Уже тяжело больной он уехал из Праги в Знаим. Узнав, что ему осталось жить всего несколько часов, Сигизмунд велел надеть на себя все императорские регалии и посадить на трон. Так, сидя на троне, он и скончался. С его смертью пресеклась мужская линия Люксембургского дома.